桂林医学院临床医学院与附属医院合署办公，附属医院创建于1958年5月，是一所集医疗、教学、科研、预防、康复、急救为一体的综合性三级甲等医院，是国家药物临床试验基地、国家临床教学示范中心、国家卫健委首批住院医师规范化培训基地、全国县级医院血液净化培训基地、中国胸痛中心认证医院、中国卒中中心联盟单位、广西临床病理质量控制中心及桂林诊断中心、广西地中海贫血产前诊断分中心等。目前，医院正推进乐群、东城和漓东新院区“一院三区”的办院新格局。医院设有54个临床专业科室、开放床位1600多张，10个医技科室，60个专科、专病门诊，6个紧密型医联体;有国家临床重点专科1个，广西医疗卫生重点学科5个、重点培育学科3个，省级临床重点专科17个，医院年门急诊量近200万人次，出院约8.5万人次，手术超过3万台次。

临床医学院负责临床医学专业、影像医学专业和儿科学专业建设及理论、实践教学运行管理工作;负责临床医学一级学科硕士点、专业学位博士点建设和运行管理工作;负责临床医学专业留学生教学运行管理工作;负责临床教学培训中心建设与组织管理工作以及学校其他专业临床相关课程的建设与管理工作。临床医学专业始建于1972年，1987年招收第一届本科生，2003年被广西教育厅批准为广西壮族自治区重点专业，2006年获内科学、外科学硕士学位授予权，2011年被教育厅批准为广西高等学校特色专业及课程一体化建设项目，同年获硕士学位一级学科授予权，2012年通过教育部临床医学专业认证，2016年获批广西优质本科专业，2019年获批自治区级一流专业，2020年获批国家级一流专业建设点，同年获临床医学博士专业学位授权点。影像医学专业2017年开始招生，儿科学专业2018年开始招生。

目前，医院在职职工3700多人，其中高级专业技术人员650余人、博士170余人，高职称、高学历医务人员之多在桂林医疗机构中稳居第一。医院有八桂学者团队、桂林市漓江学者团队、广西高校人才小高地创新团队、广西神经系统临床研究中心团队等10多个优秀科研团队。多人入选国家“百千万人才工程”人选、广西新世纪十百千人才工程第二层次人选、广西高校引进海外高层次人才“百人计划”人选、广西医学高层次骨干人才“139”计划培养人选，近30人被评为广西“卓越学者”、广西优秀专家、广西特聘专家、广西知名专家、广西名中医，100多人次担任自治区级以上各个专业学会的副主任及以上委员。构建了一批“水平高、业务强”的专任教师队伍。

医院有国家中医药科研二级实验室1个，省级重点实验室2个，广西数字医学转化工程研究中心1个，广西院士工作站1个，广西高校重点实验室1个，广西高校重点实验室培养基地1个，广西卫健委重点(重点培育)实验室4个，广西高校协同创新中心1个，广西教育厅重点学科2个、优势特色重点学科2个。

近年来，教师发表SCI论文近300篇，承担国家、省部级课题400多项，其中国家级科研项目127项，省部级科研项目281项;获得省部级科研奖励33项，其中广西自然科学奖一等奖一项，广西科技进步奖一、二、三等奖共10项，广西医药卫生适宜技术推广奖49项。

学校在人才培养、专业建设和教学改革方面取得了丰硕的成果，病理学课程为国家级一流课程，自治区级课程思政示范课;《内科学》《外科学》为自治区级一流课程，《妇产科学》等10余门课程为校级一流课程和课程思政示范课;在研各级各类教改项目近百项，年均发表教改论文20余篇;积极推动学生参加创新创业项目和大学生技能竞赛，连续8年组队参加全国高等医学院校大学生临床技能竞赛，获得了全国总决赛二等奖2次、三等奖3次和华南赛区特等奖2次、一等奖2次的佳绩。