精神卫生学院成立于1994年，设有临床医学专业(精神病学与精神卫生方向)和应用心理学两个专业。临床医学专业(精神病学与精神卫生方向)创建于1987年，原为精神医学专业，1989年招收第一届本科生，1998年教育部进行专业目录调整，改为现名，为目前国内办学最早、招生规模最大的精神医学专业之一。2004年增设四年制应用心理学本科专业，文理兼收。

现设有6个教研室和1个实验室，亚洲地区唯一的行为医学学术期刊，我国第一份以“脑科学”命名的国家级学术期刊《中华行为医学与脑科学杂志》设在我院，中华医学会行为医学分会、山东省行为医学专业委员会均挂靠我院，拥有国内行为医学专业唯一省级重点实验室“山东省行为医学重点实验室”和省级人文社科基地“山东省行为与健康研究基地”、“山东省行为医学教育研究所”、“精神卫生研究所”、“心理学研究所”、“行为医学研究所”六个研究机构。2012年5月8日在国内率先开设行为医学科，这是国内第一所在综合医院开设的行为医学科，该科的成立标志着我院在治疗心理行为疾患等方面有了重大突破。

目前，学院有专任教师16人，全部为硕士以上学历，其中博士3人，教授3人，副教授3人，学校中青年学术骨干学科带头人培养对象4人，教学名师2人，拥有“精神医学专业”、“行为医学”、“医学心理学”三支优秀教学团队，“行为医学”教学团队2011年被评为山东省教学团队，精神医学主要专业课程使用全英文教材，在国内同类专业院校中率先实施双语教学，受到学生的欢迎和同行的好评。

近年来，共承担“十一五”国家科技支撑计划、“十五”攻关课题、863、纽约CMBA、山东省自然科学基金、山东省教育厅、山东省卫生厅等多项科研项目，其中成果鉴定国际领先1项，国内领先6项;主(副)编国家级规划教材5部，出版专著30余部，发表论文200余篇;获省级优秀教学成果奖2项，厅局级以上科技奖励11项。

后期实践教学条件优越。学院现有山东省安康医院、济宁医学院附属第一人民医院两所非直属附属医院和青岛市精神卫生中心、解放军白求恩国际和平医院两所实习医院，为学生的专业理论和实践教学提供了有力保障。

对外合作和交流不断增多。先后有英国、日本、美国等7个国家的专家学者和官员来院讲学、参观访问。积极组织参加社会公益活动，先后派出6名专家教授赶赴四川地震灾区参与灾后心理干预和社区重建工作，受到社会的广泛赞誉和一致好评。

专业建设成绩显著：2008年，临床医学专业(精神病学与精神卫生方向)被评为山东省特色专业，2010年，应用心理学专业被评为校级特色专业;课程建设卓有成效：2011年，《精神病学基础》被评为山东省双语教学示范课程;《精神病和精神卫生学》为校级重点学科，《精神病学》为校级精品课程，《精神药理学》、《临床精神病学》、《精神病学基础》为校级优质课程。

近几年，学生就业率达100%，考研录取率平均达45%以上，2010届5名毕业生同时被北京大学录取，2011年在北京大学录取的9名精神卫生专业研究生中，有7名是我院毕业生。毕业生主要分布在北京、上海、广东、浙江等十多个省市，已毕业的1000余名学生中，有近700人考取了硕士和博士研究生，据2000年至2007年不完全统计，国内精神医学专业大约有200名毕业或在读博士，本科阶段就读于济宁医学院精神医学专业的有50多人。他们无论是从事临床医疗、还是教学、科研等工作，都表现出了扎实的基础理论知识、较强的专业基本技能、较高的科研能力和外语水平，深受用人单位好评。