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临床病理学于2012年开始招收研究生，为全国首批临床病理学硕士点之一。学科为住院医师规范化培训基地，省临床医学重点培育专科。建有原位杂交和PCR等检测平台。学科主攻方向和特色技术为肾脏、肝脏、乳腺、甲状腺肿瘤病理检测技术、细胞学检测技术、免疫组化检测技术、分子病理检测技术等，3项分子病理检测通过PQCC质控和CNAS能力认证。本学科以皖南医学院弋矶山医院病理科为依托，整合了芜湖市第一人民医院病理科、芜湖市第二人民医院病理科等优质临床病理师资，学术队伍结构合理。近5年，获省厅级科研课题5项，发表论文30篇，SCI收录1篇。
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