深圳大学于2008年12月获教育部批准，开设临床医学专业，同年成立深圳大学医学院，是深圳市本土第一家医学院校。中国工程院钟南山院士为医学院名誉院长。

2013年4月，为进一步整合学科资源，优化学科布局，推动深圳大学医学学科的快速发展，学校组建了深圳大学医学部。学部下设基础医学院、生物医学工程学院、药学院、护理学院、口腔医学院、公共卫生学院、国医学院(筹)、全科医学系、卡尔森国际肿瘤中心、医学人文中心等部门。国家基金委创新群体首席科学家，国家杰出青年基金获得者，基金委重大及重点项目负责人，多项国家863、973计划负责人朱卫国教授担任医学部主任。刘军山同志担任医学部党委书记。

医学部的办学定位与总体目标是立足深圳，依托粤港澳大湾区医疗卫生事业发展，面向国际，以改革和创新的精神，培养高素质复合型医学人才，为建设国际一流医学院校而努力奋斗。到2030年，争取建成国内领先、国际知名，医、教、研、产业化一体化发展的医学院校，为深圳建设成为中国特色社会主义先行示范区和“健康中国”深圳样板提供强有力支撑。

医学部现有学生3195人，其中本科生1989人，研究生1206人(含留学生39人)。现有本科专业六个：临床医学(含卓越班)、生物医学工程(含卓越班和创新班)、药学、护理学(含特色班)、口腔医学和预防医学，其中国家级一流本科专业建设点两个(临床医学专业、生物医学工程专业)，省级医学实验教学示范中心一个。一级学科博士点二个：生物医学工程、生物学，二级学科博士点一个：生物医学信息处理，一级学科硕士学位授权点两个：生物医学工程、基础医学，专业学位硕士授权点三个：生物医学工程领域工程硕士、临床医学专业硕士和药学专业硕士，国际化专业两个：分子医学硕士和生物医学工程(医学、工学、理学方向)博士。与德国耶拿大学联合培养生物医学博士项目：10名/年，通过耶拿大学博士论文答辩可以获颁耶拿大学博士学位。临床医学、生物学与生物化学分别进入ESI学科世界排名前0.5%和1%。生物医学工程学科参加全国第四轮学科评估，排名并列第15名(B类)。2019年初，深圳大学第一附属医院(深圳市第二人民医院)以深圳市唯一一家医院、广东省两家医院之一的名义进入ESI临床医学学科全球机构1%名单，标志着第一附属医院在临床医学学术水平及影响力等方面进入了国际领先水平。软科2019“中国最好学科排名”榜中，医学部基础医学学科排在全国同类学科的前29%，从2018年的第38名跃升7个名次到第31名;生物医学工程学科排在在全国同类学科的前25%，从2018年的第29名跃升8个名次到第21名。2021年度泰晤士高等教育发布的中国学科评级结果中，深圳大学医学部生物医学工程学科被评为A级学科，基础医学学科评为B级学科。

学部现有教职工620人，其中全职教研人员279人(特聘教授27人、教授35人、副教授46人、高级讲师1人、助理教授/讲师103人，研究员3人、副研究员64人)，有在站博士后180人。教研人员中大部分具有海外留学或工作经历，博士学历者占95%。高层次人才团队包括国内外院士7人，诺贝尔奖获得者1人;基金委创新群体首席科学家1人，国家自然科学基金重大项目/重大仪器研制项目首席科学家3人，国家自然科学“杰出青年基金”获得者5人、中华医学会/中国抗癌协会分会主委/候任主委3人、“优秀青年基金”获得者6人，教育部长江学者特聘教授1人、青年长江学者1人，教育部新世纪优秀人才计划入选者4人，国家级“百千万人才工程”培养对象1人、国家级教学成果奖获得者1人、国家级有突出贡献中青年专家2人，国家“万人计划”领军人才1人，享受国务院特殊津贴者6人，科技部重点研发计划、重大专项首席科学家5人，“何梁何利奖”获得者2人;广东特支计划百千万工程青年拔尖人才1人，广东特支计划科技创新青年拔尖人才1人，广东省珠江青年学者1人，珠江人才计划青年拔尖人才3人;“鹏城学者”特聘教授2人、讲座教授2人;深圳市高层次专业人才杰出人才1人、深圳市高层次专业人才国家级6人、地方级16人、后备级80人;深圳市海外高层次人才B类26人、C类100人。

医学部重视科研平台建设，提升学部整体竞争力。自成立以来，已有国家级实验室平台3个：国家生化工程技术研究中心(深圳)、医学超声关键技术国家地方联合工程实验室、医学合成生物学应用关键技术国家地方联合工程实验室;国家国际科技合作基地1个：国际肿瘤干细胞疫苗研发基地;省级重点实验室平台6个：广东省生物医学信息检测与超声成像重点实验室、广东省基因组稳定性与疾病防治重点实验室、广东省组织器官区域免疫与疾病重点实验室、广东省标准化过敏原工程技术研究中心、广东省医疗电子仪器转化工程技术研究中心、广东省天然小分子创新药物工程技术研究中心;诺奖实验室1个：深圳大学马歇尔生物医学工程实验室;市级实验室平台14个。

2008年-2021年累计承担科研项目1605项，总经费约13.4488亿，其中科技部项目37项，包括国家重点研发计划项目4项、课题9项，国家科技重大专项1项;国家自然科学基金项目656项，包括重大重点项目27项。2017年医学部作为牵头单位首次获得国家科技部资助国家重点研发计划项目2项、国家科技重大专项1项，实现了我校获此类项目资助零的突破，经费共8107.15万元，全年实际到校科研经费达到1.045208亿元(225项)，首次突破1亿元。2018-2020年国自然重点重大项目14项(其中重大项目1项，重大项目课题3项，重点项目3项，重大研究计划2项，优青3项等);科技部重点研发计划2项。2008年-2020年授权专利192项，其中发明专利117项，实用新型61项，外观专利14项，国外专利3项，PCT公开21项。2016-2021年5月31日SCI总数3463篇，其中美国科学院院报以上高质量论文的发表数量304篇，Nature、Science、Cell及其子刊59篇。2008年-2020年学部共获国际及国家、省部级以上奖励38项。

医学部位于深圳大学丽湖校区，教学、科研建筑面积7.7万平方米。现有临床教学基地24家，其中直属附属医院(含高等医学教育和行政直属附属医院)4家：深圳大学第一附属医院/深圳大学第一临床医学院(深圳市第二人民医院)、深圳大学总医院、深圳大学附属华南医院、深圳大学口腔医院(筹);非直属附属医院3家：深圳大学附属南山医院(华中科技大学协和深圳医院)、深圳大学第二附属医院 (深圳市宝安区人民医院) 、深圳大学第三附属医院(深圳市罗湖区人民医院);非直属附属医院创建单位4家：深圳市宝安区中心医院、深圳市宝安区妇幼保健院、深圳市口腔医院、深圳市龙岗区骨科医院;教学医院13家：北京大学深圳医院、香港大学深圳医院、中国医学科学院肿瘤医院深圳医院、中国医学科学院阜外医院深圳医院、深圳市第三人民医院、深圳市康宁医院、深圳市眼科医院、深圳市龙岗区妇幼保健院、深圳市龙岗区人民医院、深圳市职业病防治院、深圳市宝安区松岗人民医院、惠州市第一妇幼保健院、复星集团深圳恒生医院。

深圳大学第一附属医院/深圳大学第一临床医学院(深圳市第二人民医院)是集医疗、教学、科研、康复、预防保健和健康教育“六位一体”的现代化综合性医院;医院始建于1980年，1996年创建为国家“三级甲等”医院;2008年经国家教育部批准，成为“深圳大学第一附属医院”;2016年明确成为“深圳大学第一临床医学院”。2021年国家卫健委公布的2019年三级公立医院国家绩效考核排名(综合类)，医院排名全国第52名，全省第4名，全市第1名。

深圳大学总医院位于丽湖校区附近，它将建设成为与国际接轨的集医疗、教学、科研、康复和预防保健等为一体的三级甲等具有专科特色的综合型高端教学医院，已于2018年6月正式开业。2021年国家卫健委公布的2019年三级公立医院国家绩效考核排名(无年报综合类)，医院排名全国第103名。

深圳大学附属华南医院坐落于深圳市龙岗区平湖街道，它将建设成为临床、科研、教学、转化协同发展的本地化、数字化、国际化一流研究型医院，已于2021年4月6日正式开放全科医学门诊，计划于2021年6月30日门诊正式开业， 9月30日住院部开业。

医学部积极开展国际合作与交流，2021年7月获批成为深圳大学首批国际化示范学院整体试点单位。先后与美国、日本、英国、德国、澳大利亚、意大利、荷兰、俄罗斯、比利时、哈萨克斯坦等国家及台湾、香港和澳门等地区的知名医学院校和科研机构建立了长期广泛的合作关系。

百舸争流，千帆竞发。深圳大学医学部将秉承“慈心仁术，深医精诚”部训精神，践行“开拓进取、追求卓越”办学理念，培养适合深圳特区经济社会发展的高水平医学人才，努力将医学部建设成为国内领先、国际知名的医学科研教学基地，为全面推动深圳医疗卫生事业和相关产业跨越式发展贡献力量。