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西安交通大学医学部公共卫生学院历史最早可追溯到1949年西北医学院成立的公共卫生学科。1986年西安医科大学成立预防医学系，1997年成立公共卫生学院。2000年西安医科大学与西安交通大学、陕西财经学院三校合并，公共卫生学院为医学部下设的二级学院。
学院拥有公共卫生与预防医学一级学科博士和硕士学位授权点、公共卫生专业硕士学位授权点和一级学科博士后流动站。拥有国家卫健委微量元素与地方病研究重点实验室、陕西省营养与食品安全工程研究中心、陕西省丝路区域地方病与健康促进协同创新中心、中澳传染病联合研究中心、西安交大-伦敦大学学院分子医学与地方病联合研究中心等研究机构。下设流行病与卫生统计学系、劳动卫生与环境卫生学系、营养与食品安全系、儿少卫生与妇幼保健学系、卫生毒理与卫生检验系、地方病研究所、卫生改革与发展研究中心和实验教学中心。2016年以来，学院支撑“中国西部科技创新港——智慧学镇”(新校区)全球健康研究院建设，下设系统科学与健康大数据研究所、慢性病预防控制研究所、传染病预防控制研究所、环境与地方病防治研究所和营养与食品安全研究所，已形成一支高层次领军人才为带头人(国家级人才5人)，中青年学科骨干为核心力量，老中青结合，梯队合理，质量优良，团结奋斗的师资队伍。
遵循学校“扎根西部、服务国家、世界一流”办学定位，学院充分发挥综合大学办学优势，注重医管、医理、医文、医工学科交叉，瞄准全球健康发展前沿，对接国家卫生事业发展需求，结合我国西部社会、经济、卫生、人群健康和疾病流行特点，广泛开展公共卫生人才培养、科学研究和社会服务，努力创建特色鲜明、高水平、国际化的公共卫生与预防医学学科。在国内率先开展公共卫生硕士(1998年)和公共卫生博士(2011年)专业学位培养试点工作。20余年坚持为全体临床本科生开设暑期预防医学实践必修课程，培养其“发现和解决你身边的公共卫生问题”的能力，以弥合预防与临床的裂痕。截止2020年，学院已培养本、硕、博毕业生(包括留学生)3000余人，在西部地区就业率达到70%，成为我国西部地区医药卫生与疾病防控事业的中坚力量。
围绕我国西部人群健康重大公共卫生问题，学院形成了以妇幼营养与健康评价、环境与地方病、传染病预防控制、食品质量与安全、儿童发育与身心健康、全生命周期健康促进、卫生政策与医学伦理等为代表具有鲜明特色的研究方向。研究项目获国家科技部、基金委、卫健委和联合国儿童基金会(UNICEF)、世界卫生组织(WHO)、美国中华医学基金会(CMB)等资助。近五年新增国家级科研项目60余项，包括国家重点研发计划项目、国家重点研发计划政府间国际创新合作重点专项、传染病重大专项、国家自然科学基金国际合作重点项目和优秀青年基金项目;新增省部级科研项目80余项，横向项目40余项。研究成果在本领域国际著名期刊BMJ、Circulation、Lancet Global Health、Lancet Public Health、JAMA Pediatrics、Nature Neuroscience、Science Translational Medicine、Hepatology等发表，相关论文被认可为“F1000论文”。研究成果获得2项国际生物无机化学家协会“克劳斯•施瓦兹奖”和2项陕西省科技进步一等奖。连续主办“一带一路”全球健康国际研讨会等高水平国际会议，主编《中国医学伦理学》等3部核心期刊。
在西安交通大学“胸怀大局，无私奉献;弘扬传统，艰苦创业”西迁精神和医学部“兴医强国、艰苦奋斗、精勤育人、救死扶伤”抗战迁陕精神指引下，学院全力投入“中国西部科技创新港——智慧学镇”建设。2019年“中国西部科技创新港——智慧学镇”已正式启用，2019级新生已入驻。学院全体教职工正以饱满的工作热情，只争朝夕,不负韶华，努力为国家公共卫生事业发展做出更大的贡献。
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