徐州医科大学基础医学院始建于1962年，时称基础课部，后称基础医学部，2006年更名基础学院，2014年易名基础医学院，并成立生物科学系，2019年生物科学系单独建院。经过五十余年的建设和稳定发展，学院已成为我校历史最长、学科优势明显、师资力量雄厚、办学条件优良的二级学院。

生物学学科现为博士学位授权一级学科，并于2014年获准设立博士后科研流动站，基础医学学科是硕士学位授权一级学科。2011年，生物学成为首批江苏省高校优势学科建设工程立项学科。2014年，生物学、基础医学与药学学科等交叉融合的医药生物学学科入选为江苏高校优势学科建设工程二期项目。2018年，基础医学学科入选江苏高校优势学科建设工程三期项目。以生物学为龙头、基础医学为重点的交叉融合、协调发展的优势学科体系推动了学院的跨越式发展。

学院拥有一支学科、学缘、学历、职称结构合理，朝气蓬勃，爱岗敬业的师资队伍。目前在岗教职员工222人，其中专任教师167人，实验技术人员51人，专职行政管理人员4人。学院专任教师中，教授24人(占14%)，副教授49人(占29%);博士生导师11人，硕士生导师75人;35岁以下青年教师中，具有硕士以上学位达100%。学院自建院以来拥有“全国优秀教师”2人，“江苏省高等学校教学名师”2人;享受“国务院政府特殊津贴”13人;“教育部新世纪优秀人才”3人;“国家级有突出贡献的中青年专家”1人，“江苏省有突出贡献的中青年专家”8人;“江苏省特聘教授”9人。

学院下设教研室8个、国家级实验教学示范中心1个、省级实验教学示范中心3个，承担全校医、理、工、管四个门类28个专业的本科生、留学生、继续教育等各层次的基础医学和生物学课程的教学工作。学院现有省级一流本科课程3门，省级本科高校在线开放课程4门，爱课程国际平台课程1门;主编/副主编教材23部，其中主编教育部“十二五”国家级规划教材和省级重点教材6部。五年来，围绕以学生为主体、能力培养为目标的宗旨，学院承担各级教育教改研究课题32项，其中省级高等教育教改研究课题2项(重点项目1项);发表教育教学研究论文51篇;获得省级教育教学成果奖6项。

学院1985年开始培养硕士研究生，1996年开始联合培养博士研究生;2010年生物学和基础医学成为硕士学位授权一级学科，2013年生物学成为博士学位授权一级学科。学院现有省重点实验室3个(江苏省脑病生物信息重点实验室、江苏省免疫与代谢重点实验室、江苏省医学基因检测工程研究中心)、徐州市重点实验室3个(生理功能与损伤重点实验室、临床与实验病理学重点实验室、感染与免疫重点实验室)、科研实验中心1个(生物化学与分子生物学研究中心)。近5年，承担科研项目150余项，其中国家自然科学基金项目55项(面上项目占50%);发表SCI收录论文300余篇，最新科研成果发表在Hepatoltgy、Microbiome、Semin Cancer Biol、PNAS、J Neurosci等国际权威期刊;获得国家自然科学奖二等奖1项、省部级科技成果奖二等奖3项;已授权国家发明及实用新型专利20项。学院发挥学科和专业优势，成立了江苏省徐州医学院法医司法鉴定所和徐州市病理会诊中心，积极开展社会服务工作。学院还积极推动科研成果转化，与贵州医科大学合作研发的工程蝇生产优质蛋白技术业已成熟;以工程蝇幼虫为生物转换器，对玉米秸秆等有机废物资源化构建的生态治理综合利用生态农业体系已初具规模。

学院全体教职工紧密围绕学校建设特色鲜明的、国内先进的高水平医科大学的目标，不断深化教育教学改革，夯实教学质量;以学科建设为依托，大力加强师资队伍建设，提高科研水平;进一步加强作风建设，提高服务社会水平。基础医学院一如既往开拓创新，与时俱进，全面推进人才培养、学科建设、科学研究等各项事业全面协调、可持续发展。