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学院成立于1986年，原为浙江中医学院针推系，2003年与浙江中医学院门诊部实行“部系合一”，2006年更名为第三临床医学院，2017年增设康复医学院，与第三临床医学院合署。开设针灸推拿、康复治疗和中医康复学三个本科专业，其中针灸推拿学为教育部第一类特色专业、省高校重点建设专业、省“十三五”优势专业、新兴特色专业、国际化专业。拥有博士后流动站2个，博士点4个，硕士点18个;平行管理包括宁波市中医院、绍兴市中医院、温州市中医院等研究生培养基地14家。
学院专任教师人数70人，其中教授20人，副教授34人。博士38人，硕士30人。博士生导师16人，硕士生导师98人;研究生386名，本科生1767名。拥有国务院特殊津贴专家1人，全国中医药高等学校教学名师1人，省级教学名师3人，省优秀教师1人。全国优秀科技工作者1人，中医药传承与创新“百千万”人才工程(岐黄工程)岐黄学者1人，国家“万人计划”青年拔尖人才1人,全国老中医药专家学术经验继承工作指导老师8人，浙江省国医名师4人，省级名中医11人，浙江省有突出贡献中青年专家1人，省卫生领军人才2人，省“万人计划”青年拔尖人才2人,省“钱江人才计划”D类项目资助人员1人、省“钱江学者”特聘教授1人，省“新世纪151人才工程”重点资助培养对象1人、第一层次培养对象1人、第二层次培养对象1人、第三层次培养对象6人，省杰出青年科学基金项目获得者1人，省卫生创新人才培养对象7人、省医坛新秀培养对象11人，全国优秀中医临床人才6人,省级中青年临床名中医15人，省高校中青年学科带头人培养对象3人, “省高校领军人才培养计划”培养对象4人, 全国中医护理骨干人才2人, 省中医护理优秀人才1人。
学院拥有国家中医药管理局重点学科3个、省“重中之重”学科1个、省中医药重点学科5个;省重点实验室1个，国家中医药三级科研实验室1个;省高校创新团队1个、省科技创新团队1个。现有国家级精品课程、国家级精品资源共享课、国家级精品视频公开课、国家精品在线开放课程各1门，全国中医药联盟慕课1门，省精品课程4门，省精品在线开放课程2门。获批省级教学团队2个。学院注重科教创新，近十年立项厅局级及以上项目300余项，累计获得课题经费3500余万元，获各类科技成果奖40余项，获国家发明专利19项，实用新型专利77项。
学院遵循医学教育和人才成长规律，围绕“德才兼备、全面发展”的核心要求，落实立德树人的根本任务，建立了知识、技能、素质“三位一体”人才培养模式，着力培养理想信念坚定、专业基础扎实、实践技能过硬，适应经济社会发展需要和医药卫生事业发展需求的针灸推拿康复专业人才。近年来，学院总体就业率一直保持较高水平，向社会输送了众多高素质医学人才，用人单位满意度较高。
