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2004年，学校在医学系下设口腔医学专业，同年开始招收口腔医学专业本科学生;2010年，经学校批准设立口腔医学院，承担口腔医学专业本科、成人专升本学生的教学工作;2014年6月，口腔医学院完全独立设置，实现教学、科研、师资、党建、学工等全方位管理，整体发展。2012年建立浙江中医药大学附属口腔门诊部，2017年扩建为浙江中医药大学附属口腔医院。2022年，学校医学实训楼启用，浙江中医药大学附属口腔医院入驻5-8层，占地面积10000余平方米，拥有122张牙椅、50张病床，充分发挥医学实训楼的实验实训、临床教学、医疗服务功能，着力夯实医学专业人才培养根基。
学院现有专任教师和管理人员28人，兼职教师29人，硕士研究生导师30人，专任教师(包含兼职教师)具有副高及以上职称比例为66%，具有博士学位比例为43%，具有海外留学经历比例占47%。师资队伍中，现任中华口腔医学会副会长1人，专委会委员8人，浙江省口腔医学会副会长 1人等。
至2023年9月，学院在校生606人，其中本科生513人(含滨江学院口腔专业学生)、硕士研究生93人。
2010年学院依托临床医学硕士学位点招收硕士研究生，2014年获口腔医学硕士专业学位研究生培养资格以及专业学位硕士授予权，2015年开始招收口腔医学专业学位硕士研究生，2018年通过口腔医学专业学位授权点专项评估。至2023年9月，学院已培养硕士毕业研究生94人，目前在读研究生93人。
2015年开始学院实行研究生培养与住院医师规范化培训并轨，课程设置为公共学位课3门、专业学位课5门、以及住院医师规范化培训公共科目等;现有口腔医学研究生规范化培训基地8家。研究生在校期间考核通过并获得《口腔执业医师资格证书》及《住院医师规范化培训合格证书》比例100%，毕业研究生就业率100%。
学院研究生近三年来在二级及以上期刊发表学术论文42篇,发表SCI论文12篇，获发明专利3项，实用新型专利14项，获厅局级科研项目立项3项，校级科研项目立项2项，参与省部级科研项目研究1项;获口腔专业类竞赛国际比赛一等奖1项，国家级学科竞赛一等奖1项，全国病例比赛优胜奖1项，省部级学科竞赛三等奖2项;获全国学术大会优秀论文1篇，省部级征文比赛一等奖1项;多名学生获得国家奖学金、获评浙江省优秀毕业生。
学院积极鼓励和指导研究生申请、攻读国内外高等学府的博士研究生，学院培养的研究生入学全球牙科学排名第二的荷兰阿姆斯特大学/自由大学口腔医学中心(ACTA)博士研究生3人，入学荷兰莱顿大学博士研究生1人，获得荷兰政府奖学金1人，获得中国国家留学基金委奖学金3人，另有3人分别就读日本东北大学、上海复旦大学和武汉大学博士研究生。
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