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第三临床医学院前身为浙江中医学院针灸推拿系，始建于1978年，1984年首批增设针灸专业硕士点，1986年正式成立针灸推拿系。2004年增设康复治疗学专业，2005年被批准为硕士学位授予点。2006年5月学院更名为浙江中医药大学第三临床医学院，附属医院更名为浙江中医药大学附属第三医院。目前，全省主要地市级中医医院导师归属第三临床医学院管理。
学院及所属临床单位拥有国家中医药管理局重点学科3个、省一流学科和“重中之重”学科各1个、省中医药重点学科7个、国家一流本科专业1个(针灸推拿学)、国家一类特色专业1个、省重点专业1个、省一流专业2个、省国际化专业1个，省优势专业1个。学院浙江省针灸神经病学研究重点实验室是浙江省唯一一所致力于针灸基础研究的重点实验室，拥有在体光遗传结合的神经元荧光成像系统、多通道生物信号采集系统、膜片钳离体生理记录分析系统等研究专用设备，总价值超3500万元。近5年来，承担各类科研项目320余项，其中省部级及以上项目66项;获各类科研及教学成果奖24 项，授权专利91 项，其中发明专利19项，出版专著及教材150余部。
目前学院拥有一级学科博士后流动站2个，博士培养点5个，硕士培养点21个;拥有博士生导师20人，硕士生导师193人;在校研究生665人，其中博士研究生44人;共有研究生培养基地15家，遍布省内地市级中医医院。
学院办学历史悠久，师资力量雄厚，科研平台领先，研究生教学成果突出，校园文化活动丰富，学生培养质量较高，学院对于研究生教育培养有着丰富的经验。学院针灸推拿学、康复医学与理疗学、中医骨伤科学、中医内科学、中西医结合临床等专业在国内处于领先地位，在针灸镇痛与免疫调节研究、针灸治疗脑病研究、中西医结合肾脏疾病研究、中西医结合骨伤科疾病研究等方面处于国内同领域领先水平。
第三临床医学院正按照学校建设一流中医药大学的统一部署，不断提高教学科研质量，向一流的中医药大学阔步前进。欢迎大家报考第三临床医学院研究生。
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